В 2024/2025 навчальному році Балтський ліцей №3 працює за 5-денним робочим тижнем в 1-9 класах та 6-денним  - в 10-11 класах. Згідно Тимчасового порядку організації освітнього процесу в умовах воєнного стану у 2024/2025 навчальному році в залежності від безпекової ситуації в місті та регіоні навчання може відбуватися за очною, дистанційною або змішаною формою, при цьому перевага надається очній формі навчання. За заявами батьків для окремих учнів може бути організована сімейне або екстернатне навчання. Заняття планується проводити в одну зміну, в окремих випадках може бути організована ІІ підзміна у разі неспроможності розмістити одночасно всіх учасників освітнього процесу в укритті у випадку повітряної тривоги під час очного навчання. Початок занять о 8⁰⁰. Тривалість уроків: згідно Закону України «Про загальну середню освіту» ст. 16 п.5. Тривалість перерв: після 1,5,6-го уроків — 10 хвилин,  після 2 уроку – 25 хвилин, після 3-го уроку — 20 хвилин, після 4-го уроку - 15 хвилин. В режимі дистанційного навчання – за окремим розкладом занять з початком о 09.00 та згідно шкільного Положення про дистанційне навчання, затвердженого на засіданні педагогічної ради школи (Пр.№8 від 22.12.2020р.). О 09.00 щодня (на початку 2 уроку) проводиться загальнонаціональна хвилина мовчання та вшанування загиблих під час російської воєнної агресії.

Зміст варіативної складової робочих навчальних планів, курсів за вибором, факультативів, індивідуальних та групових занять частково реалізується за окремим розкладом в ІІ половині дня, а заняття з факультативних курсів, спецкурсів та курсів за вибором в 10-11 класах - парними гуманітарними та природничо-математичними блоками по суботах для забезпечення умов особистісно-зорієнтованого навчання, диференціації   профільності, формування індивідуальних освітніх траєкторій учнів та підготовки до професійного самовизначення.

         Гранична наповнюваність класів та тривалість уроків встановлено відповідно до Закону України "Про загальну середню освіту". Поділ класів на групи при вивченні англійської, української  та німецької мов, інформатики, трудового навчання здійснюється відповідно до нормативів, затверджених наказом МОН України від 20.02.2002р. № 128.

Відповідно Р.ІІ п.24 Статуту школи та згідно заяв батьків в початкових класах створені 2 групи продовженого дня, що працюють з 12³⁰ до 15³⁰.

Відповідно до ст. 16 Закону України “Про загальну середню освіту» на виконання Постанови КМУ від 23.07.2024р №847 «Про початок навчального року під час воєнного стану в Україні», 2024/2025 навчальний рік в Балтському ліцеї №3 розпочинається 2 вересня святом - День знань - і  закінчується 30 червня, при цьому кількість навчальних днів не перевищує 175.

Навчальні заняття організовуються за семестровою системою: І семестр - з 2 вересня по 28 грудня 2024 р., ІІ семестр - з 13 січня по 30 травня 2025 р.

Закінчується навчальний рік, як правило, проведенням державної підсумкової атестації випускників початкової, основної і старшої школи відповідно до Порядку проведення державної підсумкової атестації, затвердженого наказом Міністерства освіти і науки України від 07 грудня 2018 року № 1369, зареєстрованого в Міністерстві юстиції України 02 січня 2019 року за № 8/32979. Крім того впродовж 02-30 червня 2025р. планується проведення освітніх та культурно-спортивних заходів, в тому числі в рамках літнього шкільного табору, за окремим графіком – індивідуальні та групові консультації для учнів з освітніми втратами через умови воєнного стану, а також за потреби буде організовано проведення річного оцінювання учнів, які перебувають за кордоном і навчаються за екстернатною або сімейною формою.

Впродовж навчального року для учнів проводяться канікули: осінні з 27 жовтня  по 03 листопада 2024р., зимові з 29 грудня 2024р. по 12 січня 2025р., весняні з 23 по 30 березня 2025р. Строки канікул  впродовж року можуть варіюватись навчальним закладом за погодженням з  відділом освіти відповідно погодних умов та з метою забезпечення режиму енергозбереження, а також у зв’язку з можливим погіршенням безпекової та епідеміологічної ситуації в країні або регіоні.